Jerry Coyne, Por qué la teoría de la evolución es verdadera:

http://www.librosmaravillosos.com/porquelateoriadelaevolucionesverdadera/pdf/Por%20que%20la%20teoria%20de%20la%20evolucion%20es%20verdadera%20-%20Jerry%20A%20Coyne.pdf

El libro es clarísimo, muy interesante y estrictamente introductorio. Se lo recomiendo a cualquiera que quiera aprerender qué es la evolución desde cero.
La bibliografía "oficial" recomendada sobre el tema (más breve, y con perspectiva más histórica) es la segunda sección ("La revolución darwiniana") del capítulo 1 del libro de Teorías de la ciencia. Primeras aproximaciones. de Ginnobili (ed.).